年末調整は、勤務先が毎月の給与から差し引いてきた所得税をその年の最後に計算し直し、過不足を精算する手続きだ。毎月の源泉徴収は、年間の所得がまだ決まっていない段階で月額表の前提に沿って計算した仮の額にすぎない。年末に合計所得に応じた基礎控除や申告された控除を使って正しい年税額を出し、すでに引いた額との差を還付するか追加で差し引く。還付の時期や給与明細への反映は勤務先の精算方法で変わる。
当サイトの2026年分の試算(東京都・35歳・扶養0人・協会けんぽ、賞与なし、申告する控除なし)では、年収500万円の人は毎月12,140円、12か月で145,680円を源泉徴収される。年間の所得税は91,686円なので、差の53,994円が年末調整で戻る目安になる。この精算で直接増減するのは所得税であり、住民税や社会保険料の年額を年末調整そのもので計算し直すわけではない。
月々の税額と年の税額がずれる理由
ずれの大きな原因は、基礎控除の見込み方の違いにある。毎月の源泉徴収は基礎控除を月48,334円、年に直すと580,008円として計算している。年末調整では合計所得に応じた基礎控除で計算し直し、年収500万円の場合は1,040,000円になる。これだけで課税所得が459,992円下がる。
給与所得控除にも差があり、年収500万円では144,624円が同じ向きに効く。合わせて604,616円、年末の計算のほうが課税所得は小さい。この差にかかっていた所得税が53,909円だ。
試算の53,994円とは85円違う。毎月の税額を10円単位で四捨五入していることと、月額表の税額の式が速算表を12か月で割った形になっていることから生じる端数だ。またこの年収では課税所得の差が速算表の段をまたぐため、「差額×5%」のように一つの税率を掛けても合わない。段ごとに分けて計算すると上の数字になる。
年収300万〜1,000万円で並べた精算額
同じ条件のまま年収だけを変えると、戻る額は次のようになる。
| 年収 | 源泉徴収12か月分 → 年税額 | 還付の試算額 |
|---|
| 300万円 | 57,120円 → 26,648円 | +30,472円 |
| 400万円 | 87,840円 → 57,227円 | +30,613円 |
| 500万円 | 145,680円 → 91,686円 | +53,994円 |
| 600万円 | 214,440円 → 149,372円 | +65,068円 |
| 800万円 | 476,640円 → 434,435円 | +42,205円 |
| 1,000万円 | 830,400円 → 822,211円 | +8,189円 |
出典:LifeKurabe 手取り計算の2026年分試算(東京都・35歳・扶養0人・協会けんぽ、賞与なし・申告する控除なし、確認日2026年9月1日)
この条件では、どの年収でも精算額はプラス、戻る側に出る。金額は年収の順には並ばない。600万円の65,068円が最も大きく、1,000万円では8,189円と小さい。年収が高いほど多く戻る、とは読めない表だ。
給与明細の毎月の源泉徴収税額が表と数円ずれることもある。この試算は国税庁の「月額表の甲欄を適用する給与等に対する税額の電算機計算の特例」によっていて、階級の中間値で計算された税額表の金額とは必ずしも一致しない。その差も年末調整で精算される。
この目安が合わなくなる条件
表の金額は、次のどれかに当てはまると変わる。
- 賞与がある。賞与の源泉徴収は「賞与に対する源泉徴収税額の算出率の表」で決まり、この計算には入っていない
- 年の途中で毎月の給与額が変わった
- 生命保険料控除、iDeCo、住宅ローン控除などを申告する。その分だけ課税所得がさらに下がり、戻る額は増える
手取りの表で見ると、年末調整が触れるのは一列だけ
| 年収 | 社会保険料合計 | 所得税 |
|---|
| 300万円 | 457,728円 | 26,648円 |
| 400万円 | 598,952円 | 57,227円 |
| 500万円 | 723,148円 | 91,686円 |
| 600万円 | 881,400円 | 149,372円 |
| 800万円 | 1,164,964円 | 434,435円 |
| 1,000万円 | 1,265,684円 | 822,211円 |
出典:LifeKurabe 手取り計算の2026年度試算(東京都・35歳・扶養なし・協会けんぽ、手取り=年収−社会保険料−所得税−住民税−森林環境税、確認日2026年9月1日)
| 年収 | 住民税 | 手取り |
|---|
| 300万円 | 114,600円 | 2,400,024円 |
| 400万円 | 174,500円 | 3,168,321円 |
| 500万円 | 242,000円 | 3,942,166円 |
| 600万円 | 306,200円 | 4,662,028円 |
| 800万円 | 452,000円 | 5,947,601円 |
| 1,000万円 | 636,800円 | 7,274,305円 |
出典:LifeKurabe 手取り計算の2026年度試算(東京都・35歳・扶養なし・協会けんぽ、手取り=年収−社会保険料−所得税−住民税−森林環境税、確認日2026年9月1日)
前半の表の「所得税」は、上の精算表の「年税額」と同じ値だ。年収500万円なら、1月から12月の源泉徴収で多めに引かれていた53,994円が年末調整の精算で還付され、1年分の所得税は91,686円に落ち着く。還付がどの給与で反映されるかは勤務先による。手取り3,942,166円はその確定後の数字になる。
住民税は年末調整の対象にならず、翌年度の税額に反映される。前年の所得に翌年度かかる仕組みは住民税の課税時期の記事で扱っている。社会保険料も年末調整とは関係なく決まるため、表の社会保険料と住民税の列はそのまま残る。なお、この手取りの表は住民税を同じ年の所得にかけ、協会けんぽの料率と標準税率で計算した簡略な試算で、組合健保の人や超過課税のある自治体の人では数字が変わる。
手取りが社会保険料、所得税、住民税の順にどう決まるかは手取りの計算順の記事にまとめている。自分の年収での手取りは、当サイトの手取り計算ツールで年収を入れて確かめられる。